毛远新是毛泽民惟一的儿子，也是毛泽东认为毛氏三兄弟在世的惟一侄儿。1946年7月11日，朱旦华带着儿子毛远新和新疆监狱的共产党人一起回到延安。数日后，毛泽东邀请朱旦华母子到杨家岭家中做客。朱旦华曾回忆，毛泽东在杨家岭窑洞前，第一次看见她牵着的毛远新愣了好一会儿。当年毛远新只有5岁，圆圆的脸蛋，一双大眼睛和毛泽民长得一模一样。直至朱旦华叫毛远新喊“大伯”，毛泽东才一把抱起侄儿，说：“让我好好看看润莲的儿子。”看着毛远新。远新一点儿不怯生，问：“大伯，你怎么有毛泽东和毛主席两个名字呢？”毛泽东大笑，把侄儿举了起来，说：“你怎么也有两个名字呵？”小远新的头摇得像拨浪鼓，说：“我只有远新一个名字。妈妈，是不是？”毛泽东点着毛远新的小鼻子说：“你还有一个名字，小——调皮。”毛远新笑了，小鼻子皱皱的。从见面的第一天起，毛泽东一家都很喜欢毛远新。李讷只比毛远新大半岁，两个人很投缘，经常在一起玩，在西柏坡，也时常见面，一起玩耍。
1949年6月朱旦华和方志敏的堂弟方志纯结婚，离京赴南昌任职。7月，毛远新在北京育英小学参加了一年级考试后被公务员送到母亲身边。
1951年10月朱旦华要到全国妇联开会，毛远新知道后，缠着母亲要去北京，说他现在就读的法前院小学老师说南昌话，他一句都听不懂。他闹着要重回北京育英小学读书。那里的老师和小伙伴那么熟那么好。国庆节前夕，毛远新随朱旦华重返北京。到京第二天，康克清摸着毛远新的头对朱旦华说：“开会你带个孩子多不方便，我把远新送到他大伯那里去。”当晚，康克清回中南海把毛远新送到丰泽园。李讷一见堂弟毛远新，说不完的话，在毛泽东身边唧唧喳喳，跑前跑后，不自觉把毛岸英牺牲后那种压抑和宁静打破了。
妇联会议结束后，朱旦华去中南海看望毛泽东，准备带毛远新回南昌。毛泽东亲切地问了南昌的一些情况，包括小学教育。朱旦华顺便提到毛远新读书的法前院小学只上半天课，比育英小学差多了，孩子想回到育英小学读书。
毛泽东笑望着侄儿说道：“在我这里是温室的花朵，跟妈妈可以经风雨见世面。”毛远新大声“抢白”：“我也不住你这里，我住学校，怎么是温室的花朵呢？”侄儿天真有个性的反驳，引逗得毛泽东舒眉大笑。江青把朱旦华拉到一边，说：“自去年岸英牺牲后，主席很少笑过。今天大笑难得的很，孩子就放这儿吧。”江青认为毛远新留在北京对毛泽东改善心情有利。毛泽东心里早就希望或认可侄儿留在身边，10岁的毛远新住进了中南海，重新回到育英小学读书。
毛泽东对侄儿的爱埋在心里，也流露在一件件小事中。当时新中国百废待兴，毛泽东公务繁忙，只要有一点儿闲暇，他从不拒绝给侄儿讲故事。一天，毛远新缠着伯父讲《水浒》，毛泽东讲到鲁智深不守寺规，大盆吃肉大碗喝酒。毛远新侧着头问：“什么叫寺规？”
毛泽东点了一下侄儿的小鼻子，笑着解释寺规第一条就是和尚只能吃蔬菜。毛远新记在了心里。过了几天，全家一起吃晚饭，有盘竹叶菜。竹叶菜南方很普遍，毛泽东从小爱吃。解放初在北京却是个稀罕菜，毛泽东高兴地给侄儿夹了一筷子，毛远新摇摇头不吃。毛泽东问为什么。10岁的远新一本正经地说：“我又不想当和尚。”一桌人都愣起来。毛泽东想起鲁智深的故事，哈哈大笑。李讷问父亲笑什么，毛泽东说出原委，全家人笑得前俯后仰。李敏、李讷笑得直叫肚子疼。那些日子，毛远新只要不愿意做什么事情，顽皮的李讷就“幽”他一默：“你又不想当和尚。”丰泽园一片欢乐，一片温馨。
毛远新到毛泽东身边的第一年，毛泽东就叫身边的警卫人员教他游泳。那时候中南海还没有修游泳池，毛泽东叫人带他在中南海湖里游。毛远新没有下过水，水一过胸就慌起来，乱叫，怎么也不能浮起来。毛泽东听说后，指点侄儿：“两手前伸，两腿后蹬，头抬起来。”毛远新还是害怕，脚不敢离地。毛泽东的警卫员孙勇拿起救生圈，刚准备扔，毛泽东摆了摆手：“带救生圈学游泳学不好，要不怕水，才能征服水。手前伸后划，这不浮起来吗？再给我向前划。”毛泽东对毛远新学游泳非常关注。毛主席身边孙勇的水性最好，笑着说：“这小子，长大不当个游泳冠军，可对不住主席。”毛远新一会水，即迷上了它，经常拉扯着伯父去游泳。他人请求主席休息没戏，小远新总有办法。那段时候，警卫员和医护人员都指点小远新多想办法让毛泽东离开办公桌，多休息多游泳。
毛泽东很疼爱毛远新，在丰泽园，无论什么东西，只要有李敏、李讷的，必有毛远新的；毛泽东带小孩出外，无论是北京市郊还是北戴河，都要带上毛远新这个“小尾巴”。刘思齐(刘松林)和李敏、李讷还亲热地送给他一个外号“小豆豆”。毛远新不服小，据理说只比李讷小半岁，李讷就会和他比高矮。一直到小学毕业，毛远新个子都比李讷矮大半个头。每到这时，江青往往出来“护短”，李讷就向父母亲撒娇：“你们第一疼小豆豆，其次才是我。”一个“小”字，有意说得又响又亮，一家人亲情融融。毛远新很自然像李敏、李讷一样称呼毛泽东“爸爸”。毛泽东在谈话和信件中，也以“父”自称。
毛远新在极为优越的环境中长大。他在中南海第一次碰见彭德怀，彭大将军远远伸开双臂，走过来搂住他。毛远新还是在延安时见过彭老总，好几年过去了，个子大变样。彭德怀感叹地说：“一看见你那双大眼睛，就知道你是毛泽民的儿子。你父亲是一个很憨厚真诚的人。乖儿子……”彭德怀不知道怎么表示对毛远新的疼爱，他拽起自己油腻腻的衣袋，从里面拿出了一把花生米，彭德怀笑着说：“这可是我从朝鲜战场带回来的。”毛远新展开新换的牙齿，笑着叫：“彭伯伯好。”“好!好!”彭德怀目光一片深情，“你父亲属猴，我属狗，他大两岁。以后叫彭叔叔。”有一次国庆节观礼，彭德怀看见毛远新拱前拱后，笑着把他拉到自己身边坐着，问这问那，关心不已。中南海铁面元帅彭德怀对毛远新尚且如此，其他人就更不用说了。
1954年毛远新从育英小学毕业，被保送到北京101中学读书，成绩优异。1960年高中毕业，被通知保送到哈尔滨军事工程学院(即哈军工)读书。哈军工是一所20世纪50年代苏联帮助我国建立的尖端军事科学最高学府，许多中央首长的子女都在那里读书，陈赓任院长。毛远新将保送的消息告诉了大伯毛泽东。
毛泽东不以为然，看了毛远新一眼说：“由国家保送上大学算什么本事？有本事自己考。”1959年李讷就是自己考上北京大学历史系。毛泽东的话激发了毛远新的心劲，他不要录取通知书自己考大学。那一年，19岁的毛远新考上了清华大学无线电系。毛泽东知道后点点头，说：“这才像润莲的儿子。”
1961年元月放寒假，毛泽东正在广州主持会议，要毛远新也到广州去。那时候毛远新好几个中小学同学都在广州，他们多是哈军工的学生，一见面都鼓动毛远新到哈军工读书。见到主席，毛远新笑着讲想转学哈军工。毛泽东慈爱地望着毛远新说：“不知陈赓还要不要你。”毛远新高兴地说：“爸爸同意了!”叶剑英的儿子叶选宁一听说这消息，很快打电话给陈赓。当晚即向毛远新转告陈赓在电话中说：“高才生，欢迎欢迎，由他挑系。”
毛远新在清华无线电系读了半年，转学到哈军工导弹系无线电控制专业。
1961年庐山会议，毛泽东曾下山到九江游过一次泳，毛远新跟着去了。处暑时节，长江九江段江面很宽，波涛汹涌，江西干部说出一些理由，劝毛主席不要下水。毛泽东呵呵一笑，指了指毛远新，说：“我们中间他年纪最小，怕不怕？”毛远新大声地说：“不怕。”主席望着大家一笑，言下之意都明白了。
